Assay information: Vf_Mt7g031900_001
| Narrative | This KASP assay belongs to a set of 653 validated assays designed map to a single locus in the published Medicago truncatula transcriptome v3.5 (www.medicagohapmap.org). The marker name refers to the annotation of the corresponding M. truncatula contig or pseudogene. The assay has been integrated into a consensus map with 34 out of 67 markers published in Cottage et al., Mol Breeding (2012). Details in Webb et al.,Plant Biotechnology Journal (2015). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| References | Webb, A., Cottage, A., Wood, T., Khamassi, K., Hobbs, D., Gostkiewicz, K., White, M., Khazaei, H., Ali, M., Street, D., Duc, G., Stoddard, F., Maalouf, F., Ogbonnaya, F. C., Link, W., Thomas, J. and O'Sullivan, D. M. (2015) A SNP-based consensus genetic map for synteny-based trait targeting in faba bean (Vicia faba L.). Plant Biotechnology Journal. ISSN 1467-7652 (In Press) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Map | 2015 consensus map, AlbusxBPL10markers | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Linkage Group | Vf_Chr_5 B | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chromosome | unknown | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| cM position | 1.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Assay ID | 1203489714 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Assay Name | Vf_Mt7g031900_001 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Reference Allele Sequences |
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| Polymorphism sequence |
ATGATGATACTGAACTAACTCTGACAAACAGACCAAGGGAGAAGTTTTTTGAATG GTTCCTCAATYCCCTTTTGATCATTAAAGAACAAATTA[R]AGCTGAAAATCTAT CTGTCTCCGAAGAGGACTACCTCTGCAAATTAGTTCTCTTGAATGGTGATGCAGA GAGAAT |
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| Reference allele sequence alignment | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Validation plot | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genotype data |
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